Home Cytoskeletal Signaling HDAC Inhibitor Tubacin

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Tubacin HDAC Inhibitor

Kat.-Nr.: S2239

Tubacin ist ein hochwirksamer und selektiver, reversibler, zellgängiger HDAC6-Inhibitor mit einer IC50 von 4 nM in einem zellfreien Assay, ca. 350-fache Selektivität gegenüber HDAC1. Diese Verbindung reduziert die Replikation des Japanischen Enzephalitis-Virus durch die Verringerung der viralen RNA-Synthese.
Tubacin HDAC Inhibitor Chemical Structure

Chemische Struktur

Molekulargewicht: 721.86

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Qualitätskontrolle (Quality Control)

Charge: Reinheit: 99.19%
99.19

Zellkultur, Behandlung & Arbeitskonzentration
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Zelllinien Assay-Typ Konzentration Inkubationszeit Formulierung Aktivitätsbeschreibung PMID
mammalian cells Function assay Tested for inhibition of Histone deacetylase 6 induced acetylated tubulin in mammalian cells, EC50=2.9μM 14584932
T24 Function assay Induction of histone H3 acetylation in human T24 cells, EC50=2.9μM 19111466
RAW264.7 Function assay Protection against Bacillus anthracis protective antigen and lethal toxin-diphtheria toxin chimeric protein mediated cytotoxicity in mouse RAW264.7 cells assessed as cell viability 16408003
CHO Function assay Inhibition of Bacillus anthracis anthrax protective antigen heptamer pre-pore to pore conversion in CMG2-expressing CHO cells 23964961
HeLa Function assay 6 hrs Inhibition of HDAC6 in human HeLa cells assessed as reduction in K40 hyperacetylation of alpha-tubulin incubated for 6 hrs by immunofluorescence assay, IC50=2.9μM 25454270
DAOY qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for DAOY cells 29435139
SJ-GBM2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SJ-GBM2 cells 29435139
A673 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for A673 cells 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
BT-37 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-37 cells 29435139
NB-EBc1 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB-EBc1 cells 29435139
SK-N-SH qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-SH cells 29435139
NB1643 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB1643 cells 29435139
LAN-5 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for LAN-5 cells 29435139
BT-12 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-12 cells 29435139
Rh18 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Rh18 cells 29435139
OHS-50 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for OHS-50 cells 29435139
RD qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for RD cells 29435139
MG 63 (6-TG R) qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for MG 63 (6-TG R) cells 29435139
Rh30 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Rh30 cells 29435139
Rh41 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Rh41 cells 29435139
A549 Function assay 20 hrs Inhibition of HDAC-6 in human A549 cells assessed as induction of alpha-tubulin acetylation after 20 hrs by cytoblot analysis, EC50=2.5μM ChEMBL
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Chemische Informationen, Lagerung & Stabilität (Chemical Information, Storage & Stability)

Molekulargewicht 721.86 Formel

C41H43N3O7S

 Lagerung (Ab Erhaltdatum)
CAS-Nr. 537049-40-4 -- Lagerung von Stammlösungen

Synonyme N/A Smiles C1C(OC(OC1C2=CC=C(C=C2)CO)C3=CC=C(C=C3)NC(=O)CCCCCCC(=O)NO)CSC4=NC(=C(O4)C5=CC=CC=C5)C6=CC=CC=C6

Löslichkeit (Solubility)

In vitro
Charge:

DMSO : 100 mg/mL (138.53 mM)
(Feuchtigkeitskontaminiertes DMSO kann die Löslichkeit verringern. Verwenden Sie frisches, wasserfreies DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Molaritätsrechner

Masse Konzentration Volumen Molekulargewicht
Verdünnungsrechner Molekulargewicht-Rechner

In vivo
Charge:

In-vivo-Formulierungsrechner (Klare Lösung)

Schritt 1: Geben Sie unten die Informationen ein (Empfohlen: Ein zusätzliches Tier einplanen, um Verluste während des Experiments auszugleichen)

mg/kg g μL

Schritt 2: Geben Sie die In-vivo-Formulierung ein (Dies ist nur der Rechner, nicht die Formulierung. Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn im Abschnitt Löslichkeit keine In-vivo-Formulierung angegeben ist.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berechnungsergebnisse:

Arbeitskonzentration: mg/ml;

Methode zur Herstellung der DMSO-Stammflüssigkeit: mg Wirkstoff voraufgelöst in μL DMSO ( Konzentration der Stammflüssigkeit mg/mL, Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn die Konzentration die DMSO-Löslichkeit der jeweiligen Wirkstoffcharge überschreitet. )

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammflüssigkeit, fügen Sie als Nächstes hinzuμL PEG300, mischen und aufklären, fügen Sie als Nächstes hinzuμL Tween 80, mischen und aufklären, fügen Sie als Nächstes hinzu μL ddH2O, mischen und aufklären.

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammflüssigkeit, fügen Sie als Nächstes hinzu μL Maisöl, mischen und aufklären.

Hinweis: 1. Bitte stellen Sie sicher, dass die Flüssigkeit klar ist, bevor Sie das nächste Lösungsmittel hinzufügen.
2. Achten Sie darauf, die Lösungsmittel in der richtigen Reihenfolge hinzuzufügen. Sie müssen sicherstellen, dass die im vorherigen Schritt erhaltene Lösung klar ist, bevor Sie das nächste Lösungsmittel hinzufügen. Physikalische Methoden wie Vortexen, Ultraschall oder ein warmes Wasserbad können zur Unterstützung des Lösungsvorgangs verwendet werden.

Wirkungsmechanismus (Mechanism of Action)

Eigenschaften
The first known selective inhibitor of α-tubulin deacetylation.
Targets/IC50/Ki
HDAC6
(Cell-free assay)
4 nM
In vitro

Tubacin, without directly stabilizing microtubules, induces an increase in α-tubulin acetylation with EC50 of 2.5 μM in A549 cells. This compound inhibits HDAC6-mediated α-tubulin deacetylation, and inhibits the migration of both wild-type and HDAC6-overexpressing cells. It in combination synergistically enhances tubulin acetylation. This chemical significantly inhibits both drug-sensitive and drug–resistant MM cell growth with IC50 of 5–20 μM, and induces cell apoptosis by activation of caspases.

Kinase-Assay
Enzymhemmtest
Enzymhemmtests werden unter Verwendung der Reaction Biology HDAC Spectrum Plattform durchgeführt. Die HDAC1-, 2-, 4-, 5-, 6-, 7-, 8-, 9-, 10- und 11-Assays verwendeten isoliertes rekombinantes menschliches Protein; der HDAC3/NcoR2-Komplex wird für den HDAC3-Assay verwendet. Das Substrat für die HDAC1-, 2-, 3-, 6-, 10- und 11-Assays ist ein fluorogenes Peptid aus den p53-Resten 379-382 (RHKKAc); das Substrat für HDAC8 ist ein fluorogenes Diacylpeptid, das auf den Resten 379-382 von p53 (RHKAcKAc) basiert. Acetyl-Lys(trifluoracetyl)-AMC-Substrat wird für die HDAC4-, 5-, 7- und 9-Assays verwendet. Verbindungen werden in DMSO gelöst und in einem 10-Dosis-IC50-Modus mit 3-facher serieller Verdünnung ab 30 μM getestet. Die Kontrollverbindung Trichostatin A (TSA) wird in einem 10-Dosis-IC50 mit 3-facher serieller Verdünnung ab 5 μM getestet. IC50-Werte werden durch Kurvenanpassung der Dosis-Wirkungs-Steigungen extrahiert.
In vivo

In chick embryos, inhibition of HDAC6 activity by Tubacin reduces the formation of new blood vessels in matrigel/nylon mesh. In angioreactors implanted in mice, this compound also impairs the formation of new blood vessels.

Referenzen
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15937109/
  • [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21359602/

Anwendungen (Applications)

Methoden Biomarker Bilder PMID
Western blot Acetyl-α-tubulin / α-tubulin / pERK / ERK / p-MLC / MLC
S2239-WB1
26783207
Immunofluorescence p62 / HDAC6 Phalloidin / MYH9 Acetylated Microtubules / Viral HA
S2239-IF1
26643866
Growth inhibition assay Cell viability
S2239-viability1
29845122