Home Epigenetics HDAC Hemmer Tubastatin A Hydrochloride

Nur für die Forschung bestimmt

Tubastatin A Hydrochloride HDAC6-Inhibitor

Kat.-Nr.: S2627

Tubastatin A HCl ist ein potenter und selektiver HDAC6-Inhibitor mit einer IC50 von 15 nM in einem zellfreien Assay. Er ist selektiv (1000-fach höher) gegenüber allen anderen Isozymen außer HDAC8 (57-fach höher).
Tubastatin A Hydrochloride HDAC Hemmer Chemical Structure

Chemische Struktur

Molekulargewicht: 371.86

Springen zu

Qualitätskontrolle (Quality Control)

Charge: Reinheit: 99.38%
99.38

Zellkultur, Behandlung & Arbeitskonzentration
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Zelllinien Assay-Typ Konzentration Inkubationszeit Formulierung Aktivitätsbeschreibung PMID
neuron cultures Kinase assay 2.5 μM DMSO induces α-tubulin hyperacetylation
neuron cultures Function assay ~10 μM DMSO protects against glutathione depletion-induced oxidative stress
134/04 Function assay 7.5 µM impairs myotube formation
C2C12 Function assay 7.5 µM impairs myotube formation
HaCaT keratinocytes Function assay 10 μM blocks arsenite from inducing Nrf2 protein translation
JURL-MK1 Function assay 10 μM enhances cell adhesivity to fibronectin
CML-T1 Function assay 10 μM enhances cell adhesivity to fibronectin
K562 Function assay 10 μM enhances cell adhesivity to fibronectin
HL-60 Function assay 10 μM enhances cell adhesivity to fibronectin
KMCH Growth inhibitory assay ~10 μM decreases proliferation and anchorage-independent growth
THP-1 Function assay ~10 μM inhibits TNF-α and IL-6 secretion
RAW 264.7 Function assay ~10 μM attenuates NO production
HT3 Function assay ~5 μM DMSO induces the differential α-tubulin acetylation
SiHa Function assay ~5 μM DMSO induces the differential α-tubulin acetylation
CaSki Function assay ~5 μM DMSO induces the differential α-tubulin acetylation
SiHa Function assay ~5 μM DMSO inhibits Thapsigargin- or EGF-induced SOCE activation
CaSki Function assay ~5 μM DMSO inhibits Thapsigargin- or EGF-induced SOCE activation
MCF-7 Growth inhibitory assay 30 μM DMSO IC50=15 μM
MCF-7 Function assay 30 μM DMSO increases the microtubule acetylation level.
MCF-7 Function assay 30 μM DMSO stabilizes microtubules against cold-induced depolymerization
MCF-7 Function assay 15 μM DMSO stabilizes microtubules against nocodazole-induced disassembly
MCF-7 Function assay 30 μM DMSO alteres the assembly dynamics of interphase microtubules
MCF-7 Function assay 30 μM DMSO increases the binding of HDAC6 with interphase microtubules
PC12 Function assay ~3 μM DMSO up-regulates anti-oxidative gene expression related to transcription factor XBP1s
PC12 Growth inhibitory assay ~3 μM DMSO reverse H2O2-induced growth inhibition
HEK293T Function assay ~3 μM DMSO up-regulated XBP1s protein level
HEK293T Function assay ~3 μM DMSO delays XBP1s protein degradation via acetylation-mediated proteasomal degradation
Huh7 Function assay ~5 μM DMSO suppresses proliferation of hepatitis C virus replicon with EC50 = 0.3 μM
SKMEL21 Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
SKMEL103 Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
SKMEL28 Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
WM164 Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
WM1361a Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
WM1366 Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
WM793 Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
WM35 Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
WM983a Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
WM793 Function assay ~6 μM DMSO induce G1 arrest
WM164 Function assay ~6 μM DMSO induce G1 arrest
WM983a Function assay ~6 μM DMSO induce G1 arrest
WM164 Function assay ~3 μM DMSO augments expression of MHC class I and melanoma associated antigens
WM983a Function assay ~3 μM DMSO augments expression of MHC class I and melanoma associated antigens
IPC298 Function assay ~3 μM DMSO augments expression of MHC class I and melanoma associated antigens
SKMEL30 Function assay ~3 μM DMSO augments expression of MHC class I and melanoma associated antigens
TCa83 Function assay induces PTEN expression and membrane translocation
293T Function assay ~2 μg/ml induces PTEN expression and membrane translocation
SACC-83 Function assay ~2 μg/ml induces PTEN expression and membrane translocation
293T Function assay ~2 μg/ml induces PTEN acetylation at K163
U-87 MG Function assay ~2 μg/ml inhibits the migration and invasion
U-87 MG Function assay ~10 μM inhibits AKT phosphorylation
U-87 MG Growth inhibitory assay ~10 μM inhibits cell growth
Klicken Sie hier, um weitere experimentelle Zellliniendaten anzuzeigen

Chemische Informationen, Lagerung & Stabilität (Chemical Information, Storage & Stability)

Molekulargewicht 371.86 Formel

C20H21N3O2.HCl

 Lagerung (Ab Erhaltdatum)
CAS-Nr. 1310693-92-5 SDF herunterladen Lagerung von Stammlösungen

Löslichkeit (Solubility)

In vitro
Charge:

DMSO : 74 mg/mL (198.99 mM)
(Feuchtigkeitskontaminiertes DMSO kann die Löslichkeit verringern. Verwenden Sie frisches, wasserfreies DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Molaritätsrechner

Masse Konzentration Volumen Molekulargewicht
Verdünnungsrechner Molekulargewicht-Rechner

In vivo
Charge:

In-vivo-Formulierungsrechner (Klare Lösung)

Schritt 1: Geben Sie unten die Informationen ein (Empfohlen: Ein zusätzliches Tier einplanen, um Verluste während des Experiments auszugleichen)

mg/kg g μL

Schritt 2: Geben Sie die In-vivo-Formulierung ein (Dies ist nur der Rechner, nicht die Formulierung. Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn im Abschnitt Löslichkeit keine In-vivo-Formulierung angegeben ist.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berechnungsergebnisse:

Arbeitskonzentration: mg/ml;

Methode zur Herstellung der DMSO-Stammflüssigkeit: mg Wirkstoff voraufgelöst in μL DMSO ( Konzentration der Stammflüssigkeit mg/mL, Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn die Konzentration die DMSO-Löslichkeit der jeweiligen Wirkstoffcharge überschreitet. )

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammflüssigkeit, fügen Sie als Nächstes hinzuμL PEG300, mischen und aufklären, fügen Sie als Nächstes hinzuμL Tween 80, mischen und aufklären, fügen Sie als Nächstes hinzu μL ddH2O, mischen und aufklären.

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammflüssigkeit, fügen Sie als Nächstes hinzu μL Maisöl, mischen und aufklären.

Hinweis: 1. Bitte stellen Sie sicher, dass die Flüssigkeit klar ist, bevor Sie das nächste Lösungsmittel hinzufügen.
2. Achten Sie darauf, die Lösungsmittel in der richtigen Reihenfolge hinzuzufügen. Sie müssen sicherstellen, dass die im vorherigen Schritt erhaltene Lösung klar ist, bevor Sie das nächste Lösungsmittel hinzufügen. Physikalische Methoden wie Vortexen, Ultraschall oder ein warmes Wasserbad können zur Unterstützung des Lösungsvorgangs verwendet werden.

Wirkungsmechanismus (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
HDAC6
(Cell-free assay)
15 nM
HDAC8
(Cell-free assay)
854 nM
In vitro
Tubastatin A is substantially selective for all 11 HDAC isoforms and maintains over 1000-fold selectivity against all isoforms excluding HDAC8, where it has approximately 57-fold selectivity. In homocysteic acid (HCA) induced neurodegeneration assays, Tubastatin A displays dose-dependent protection against HCA-induced neuronal cell death starting at 5 μM with near complete protection at 10 μM. At 100 ng/mL Tubastatin A increases Foxp3+ T-regulatory cells (Tregs) suppression of T cell proliferation in vitro. Tubastatin A treatment in C2C12 cells would lead to myotube formation impairment when alpha-tubulin is hyperacetylated early in the myogenic process; however, myotube elongation occurs when alpha-tubulin is hyeperacetylated in myotubes. A recent study indicates that Tubastatin A treatment increases cell elasticity as revealed by atomic force microscopy (AFM) tests without exerting drastic changes to the actin microfilament or microtubule networks in mouse ovarian cancer cell lines, MOSE-E and MOSE-L.
Kinase-Assay
Enzymhemmungstests
Enzymhemmungstests werden von der Reaction Biology Corporation, Malvern, PA, unter Verwendung der Reaction Biology HDAC Spectrum Plattform durchgeführt. (www.reactionbiology.com) Die HDAC1-, 2-,4-, 5-, 6-, 7-, 8-, 9-, 10- und 11-Assays verwenden isoliertes rekombinantes menschliches Protein; für den HDAC3-Assay wird der HDAC3/NcoR2-Komplex verwendet. Das Substrat für die HDAC1-, 2-, 3-, 6-, 10- und 11-Assays ist ein fluorogenes Peptid aus p53-Resten 379-382 (RHKKAc); das Substrat für HDAC8 ist ein fluorogenes Diacylpeptid, das auf den Resten 379-382 von p53 (RHKAcKAc) basiert. Acetyl-Lys (Trifluoracetyl)-AMC-Substrat wird für die HDAC4-, 5-, 7- und 9-Assays verwendet. Tubastatin A wird in DMSO gelöst und im 10-Dosis-IC50-Modus mit einer 3-fachen Reihenverdünnung ab 30 μM getestet. Die Kontrollsubstanz Trichostatin A (TSA) wird in einem 10-Dosis-IC50-Modus mit einer 3-fachen Reihenverdünnung ab 5 μM getestet. IC50-Werte werden durch Kurvenanpassung der Dosis-Wirkungs-Kurven extrahiert.
In vivo
Daily treatment of Tubastatin A at 0.5mg/kg inhibits HDAC6 to promote Tregs suppressive activity in mouse models of inflammation and autoimmunity, including multiple forms of experimental colitis and fully major histocompatibility complex (MHC)-incompatible cardiac allograft rejection.
Referenzen
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22446682/

Anwendungen (Applications)

Methoden Biomarker Bilder PMID
Western blot EGFR / p-AKT / AKT / p-ERK / ERK
S2627-WB1
29665050
Immunofluorescence α-tubulin / Acetylated tubulin HDAC6
S2627-IF1
23798680